Bist du dir sicher, dass du eine zweite Instanz haben willst?
Wenn möglich sollte man nur mit einer Instanz arbeiten.
Sollen nur die Benutzerdatenbanken auf einem anderen Pfad liegen oder auch die System und / oder TempDB?
Für Benutzerdatenbanken sind die beiden Einstellungen "Benutzerdatenbankverzeichnis" und "Benutzerdatenbank-Protokollverzeichnis" zuständig.