Variablen mit Kleinbuchstaben kannst Du NICHT per Commandline ändern - das geht nur bei Variablen, die komplett GROSSGESCHRIEBEN sind. Ist eine Konvention bei MSI-Paketen.
Du mußt rausfinden, welche InstallLevel und ggf. Conditions die einzelnen Features des Pakets haben, und dann kannst Du agieren. Wenn Du weißt, wie die Features heißen, die Du brauchst:
ADDLOCAL=Feature1,Feature2,Feature3
führt zum Ziel.
PS: Nein, das ist nicht geraten - ich hab ne InstallShield Premier Lizenz :D