mhh ist die platte voll, halb voll, sind es schnelle oder langsame platten?
soll bedeuten das man das nicht so pauschal sagen kann(mit so wenig angaben)
je nachdem ob es der controller unterstützt kannst du sogar den server nach dem anstossen des sync´s direkt starten und er macht es im laufenden betrieb.
ich würde dir aber vorschlagen mal in das handbuch vom board/controller zu schauen.