Die Probleme kenne ich recht gut, Windows ist da eine Diva, erst antäuschen, also kurz anfangen auf dem neuem System zu booten, dann Blue screen oder Neustart.
Vor dem Wechsel auf das neue System in dem altem System den Standarttreiber für IDE einstellen, runterfahren, auf das neue System rüber.
Schon unter Win2k hat das gut geklappt, einige Aufrüstungen gab es dabei, auch von AMD zu Intel etc, allerdings hatte ich das mit Umzug der Festplatte gemacht, sei es auch nur zum direktem Kopieren von alter auf neue Platte.