Du kannst mit "w32tm /query ..." den Status der Synchronisation überprüfen (Peers, Offset, letzte erfolgreiche Synchronisation, ...). Generell empfehle ich, die Systemzeit entweder per NTP oder über die Integration Services mit dem Hypervisor zu synchronisieren. Andernfalls hat man gern mal das Problem, dass die per NTP synchronisierte Zeit gleich wieder übersteuert wird.
Wenn du dich für NTP entscheidest, wähle das Synchronisationsintervall nicht zu groß. Ist der Offset erst mal zu groß, funktioniert die Re-Synchronisation nicht mehr. Die Einstellungen für Intervall, max. Abweichung, etc. machst du per Gruppenrichtlinie. Wenn die Systemuhr immer noch Drift zeigt, kannst du dort auch Einstellungen zur Korrektur des Drifts vornehmen.