Moin,
ich glaube ich weiß jetzt was das Problem ist ..
Nach einem Aufruf von aspnet_regiis mit der Option -i im Verzeichnis von C:\WINDOWS\microsoft.net\Framework64\v 2.0.50727\ erhielt ich die Info, dass der IIS warum auch immer im 32bit Mode läuft, während auf dem Server(x64) auch SharePoint Services(x64) installiert werden muss, weil SharePoint Services(x86) nicht auf einem x64-System installiert werden kann.
Wie krieg ich jetzt den IIS in den 64-bit Modus um ASP.NET 2.0 (x64) zu registrieren?
//Edit
Problem solved!
Unter How to switch between the 32-bit versions of ASP.NET 1.1 and the 64-bit version of ASP.NET 2.0 on a 64-bit version of Windows findet man eine Anleitung wie man den IIS aus dem 32 bit Mode rausbekommt.
Jetzt muss man nur noch die x64-Variante von ASP.NET mit Hilfe von "aspnet_regiis.exe -i" (unter dem Framework64 Verzeichnis) wieder installieren, dann im IIS auf "allow" setzen und schon kann man die Sharepoint Services (x64) installieren.