Hallo, 
  
ist das hier noch aktuell? 
  
Wenn Du einen Linuxkiste als Mailserver hast, kann ich Dir evtl. diese beiden Tools hier ans Herz legen... 
  
IMAP Migrationstool (PHP) 
  
und zweitens dieses hier: 
  
IMAP-Sync 
  
Dort findest Du direkt auch ein kurzes Tutorial. 
  
Ich Test gerade den Microsoft Migrationsassistenten um einen IMAP-Account auf den Exchange umzuziehen. Also das scheint geklappt zu haben. Es wurden auch keine Mails als ungelesen markiert ;) 
  
Um einen oder mehrere Accounts umzuziehen musst Du eine ".csv" Datei nach folgendem Vorbild erstellen: 
  
IMAP_Mailbox,SMTP_Address,IMAP_Password,IMAP_Server 
Ted,Ted@legacy.fabrikam.com,password,192.168.202.101 
Birgit,Birgit@legacy.fabrikam.com,password,192.168.202.101 
Kim,Kim@legacy.fabrikam.com,password,192.168.202.101 
  
Das hat bei mir jetzt gerade einwandfrei funktioniert . Vielleicht hilft Dir das weiter..