Hi,
wie alles im leben, kommt es auf vorhandenen Kleingeld drauf an was das beste wäre!
Usb-Stick und Fingerprint als AD authentifizierung ist zwar zu bewergstelligen und auch "kostengünstig" jedoch würde ich davon abraten da die technik noch nicht soweit ausgereift ist (Fingerprint).
Beste lösung wäre ein PKI System aufzusetzen und mit Smart Card anmeldung zu arbeiten.
Wäre aber auch hilfreich wenn mehr Infos da wäre. Z.B welche anderen Sicherheitsvorkehrungen sich im Netz befinden.