Keine Ahung, was die SAPGUI immer mit dem IE anstellt.
Mit Web Dynpro gibt es hier auch immer Probleme (auch beim IE8).
ich würde mal prüfen, ob (noch) die richtige mshtml.tlb registriert ist:
SAP Community Network Forums: sapgui 7.10 patch 9 break "something" ...
Probleme können genau damit auftreten, wenn bestimme SAPGUI's deinstalliert werden.
Nur ins Blaue geraten.